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Isoform定量轉錄組測序即Isoform定量全長轉錄組測序,是指使用Nanopore,無需打斷直接對cDNA進行測序,獲得高質量的全長轉錄本序列。可準確識別可變剪接、基因融合、可選擇性多聚腺苷酸化(APA)和等位基因,并對異構體進行準確定量。

產品優勢


由于可變剪切(超過90%人類基因要通過可變剪切產生轉錄本,其中60%的剪切變體會編碼出不同的蛋白質異構體)的存在,一個基因往往對應多個轉錄本(Isoform),二代轉錄組只能對基因進行定量(基于最長轉錄本進行GO、KEGG等分析),Isoform定量全長轉錄組可實現轉錄本定量,對基因的每一個Isoform進行功能注釋。


圖1 Isoform定量全長轉錄組和二代轉錄組建庫和比對分析和定量示意圖
 
注釋:二代轉錄組只能對基因進行定量,不能實現轉錄本定量,功能分析(GO、KEGG等)是基于最長轉錄本進行分析;Isoform定量轉錄組可實現不同Isoform的定量,對所有轉錄本進行功能分析。


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